多平台、多方法RNA文库构建-北京全式金生物(TransGen Biotech)

多平台、多方法RNA文库构建

RNA是以DNA的一条链为模板，以碱基互补配对原则，转录而形成的一条单链，主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达，是遗传信息传递过程中的桥梁，主要存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中。

众所周知，total RNA中95%以上都是核糖体RNA（rRNA），可rRNA却非常保守，在不同的组织、器官当中的表达极度稳定；而只占total RNA总量2%-3%的mRNA在RNA当中信息含量却最为丰富，因此mRNA成为人们在科学研究中的重要关注点。

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组织或细胞总RNA中各种RNA分布饼状图

而某个物种的特定组织或细胞在某一生理功能状态下发生的mRNA产物的转录，即转录组，是基因组遗传信息传递和表达的重要步骤和过程。

通过高通量mRNA测序可以获得大量转录本序列信息，定量基因转录表达水平，获得基因组转录区域及其位点信息等，在基因组序列拼接注释、样品间基因转录差异表达及其功能研究等方面有重要作用。可从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理，已被广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

RNA样本的建库质量对于后续上机测序至关重要，可直接影响后续结果的分析。因此，一个好的建库试剂盒对于RNA测序至关重要。全式金目前已推出2款RNA建库试剂盒，分别适用于Illumina和MGI平台，均具有高数据质量、高文库转化率的特点。

快速RNA建库

➣ TransNGS^® Fast RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina^®

针对Illumina高通量测序平台开发的专用于构建链特异性或非链特异性转录组文库的试剂盒，可一步完成二链合成、末端修复与加A反应，中间不需要纯化步骤，极大地简化了操作流程，缩短了建库时间，可在3 h之内将0.1 ng-100 ng处理后的RNA构建成高质量的测序文库，得到的文库产量高、信息完整。

● 文库构建原理示意图

● 与竞品的比较

使用 mRNA 纯化试剂盒对人、小鼠、小麦和烟草的总RNA进行mRNA捕获，其中人和小鼠投入200 ng总RNA，小麦和烟草投入1000 ng总RNA；分别使用TransGen和Company V建库试剂盒进行RNA文库构建，文库分选后检测文库产量、峰型，并进行测序分析。

✼ 文库产量

✼ 建库峰型

✼测序数据质量

✼相关性分析

➣ TransNGS^® Fast RNA-Seq Library Prep Kit for MGI^®

本产品是针对MGI高通量测序平台开发的专用于构建链特异性或非链特异性转录组文库的试剂盒，可一步完成二链合成、末端修复与加A反应，中间不需要纯化步骤，简化了操作流程，缩短了建库时间，可在3 h之内将0.1 ng-100 ng处理后的RNA构建成高质量的测序文库，得到的文库产量高、信息完整。

● 文库构建原理示意图

● 与竞品的比较

使用TransGen和Company Y产品进行RNA建库，比较不同投入量、不同物种、不同完整度RNA 建库效果。TransGen 产品在产量上较竞品有较大优势，适配不同物种、不同质量的RNA 的样品，片段化条件兼容性强，各种类链特异性文库中的链特异性占比都在98% 以上，测序数据质量优异。

✼文库产量

✼文库峰型

✼测序数据质量

相关产品推荐

➣ TransNGS^® rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

●产品特点

✧ 可有效去除人/小鼠/大鼠高达99%的ribosomal RNA。

✧ 提供Control qPCR Primer Sets，检测去除前后ribosomal RNA和非ribosomal RNA含量的变化。

●稳定性数据

分别使用不同批次产品对1 μg 总RNA (HepG2 细胞) 进行rRNA 去除，并使用rRNA Primer 和Non-rRNA Primer 对未去除和去除后的RNA 样品同时进行qRT-PCR 检测，根据不同引物的ΔCq 值变化( 去除后样品Cq 值减去未去除样品Cq 值) 判断产品批次间的稳定性，不同批次间ΔCq 值无明显差异，产品批次间稳定性好。